生物质燃料发热量低于7000kj/kg左右，水分大于50%，锅炉内会先形成水蒸气来释放吸热，然后进行燃烧放热，并导致锅炉频繁的冒正压。由于锅炉内大量的水蒸气降低了炉膛温度，在加入的氧在水蒸气的环绕下，形成屏障，从而难以与火焰进行充分混合，以致燃烧缺氧。

生物质锅炉的尾部烟道飞灰的问题，当大量未完全燃烧的飞灰进入了尾部烟道，导致在预除尘器和灰库放灰时，灼热的飞灰遇到空气就会有明显的火星，很容易烧坏除尘器布袋，并加速引风机叶轮的磨损。

一般来讲，水分的存在使生物质中可燃物质的含量相对减少，热值降低。水分含量多使着火困难，影响燃烧速度。尽管水分不是一种可燃成份，但是其析出过程中的“造孔效应”使其起到了与可燃成份同样重要的作用。从表1可以看出，各种生物质颗粒燃料的水分含量均小于10%，其中，玉米秸秆相对来说更容易着火。